L’Istituto offre la possibilità di frequentare i corsi di laurea triennale, i corsi comuni della laurea specialistica e quelli dell’indirizzo pedagogico-didattico sia nella sede fiorentina che nei poli di Arezzo, Pisa e Siena attraverso la Formazione A Distanza (FAD) che viene svolta in maniera sincrona secondo quanto previsto dalle morme emanate dalla Congregazione per l’Educazione Cattolica.
La didattica FAD proposta dall’Istituto Superiore di Scienze Religiose della Toscana prevede che il docente titolare del corso svolga la lezione in sede o in uno dei poli mentre nei poli sono presenti docenti collaboratori o tutor che facilitano la fruizione delle lezioni e collaborano alla didattica, fin dalla programmazione dei corsi.
Le lezioni dei corsi di specifici degli indirizzi “Cristianesimo e religioni” e “Pastorale ministeriale” si svolgono in modalità tradizionale presso la sede di Firenze, quelle dell’indirizzo “Arte Sacra” esclusivamente presso il polo di Arezzo.